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Conda

安装 Anaconda 1

Anaconda

Anaconda 是一个面向语言科学计算的跨平台的开源 Python 和 R 语言发行版，内置强大的环境管理与包管理工具 Conda，支持多语言环境的隔离和切换，并集成了超过 1500 个预编译的科学计算、数据处理和机器学习相关的软件包。与 Pip 使用需编译的源码包相比（如今已支持二进制 Wheel 包），Conda 采用二进制分发模式，直接包含可执行文件与静态链接库，避免了可能的编译难题。

访问 Anaconda Archive 官网 (1)，选择相应架构（如 Linux-x86_64）的最新版本下载

  1. 此外，也可以访问 Download Anaconda Distribution | Anaconda 获取最新版本

可以通过 wget 命令在终端中下载，例如：

$ wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2025.06-0-Linux-x86_64.sh

执行下列命令，安装 Anaconda 发行版

不要以管理员身份运行

如果使用 sudo 以管理员身份运行，Anaconda 将安装至 root 目录，之后安装软件包时可能会出现权限问题

$ bash ${Anaconda3-xxxx.xx-xx-Linux-x86_64.sh}

按下回车键继续，查看许可协议

使用上下方向键阅读协议，最后输入 yes 并回车确认

确认安装位置，默认位置为 ~/anaconda3，按下回车或输入新位置继续安装

选择是否初始化 conda：

  • yes：更新 bash 配置文件，使其能够识别 conda 命令，并默认激活 base 环境 (1)
  • no：不会修改 bash 配置文件，如果后续使用 conda，需要手动初始化
  1. 如果需要取消默认激活 base 环境，可以使用下列命令：
$ conda config --set auto_activate_base false
手动初始化 conda

如果需要手动初始化 conda，可以使用下列命令：

将 ${PATH_TO_CONDA} 替换为 Anaconda 的安装目录，默认为 ~/anaconda3

$ source ${PATH_TO_CONDA}/bin/activate
$ conda init --all # (1)!
  1. --all 选项将初始化所有支持的 shell，详见：conda init — conda documentation

安装完成，重启终端即可使用 conda

安装 Miniconda 2

Miniconda

Miniconda 是一个更轻量级的 Python 环境管理工具，它仅包含 Conda 包管理器、Python 解释器及少量核心依赖，相比 Anaconda 预装的数百个科学计算包，Miniconda 具有更小的安装体积（通常仅 200MB）和更低的内存占用，尤其适用于服务器部署或快速构建纯净隔离的项目环境。

执行下列命令，下载 Miniconda 最新发行版 (1)

  1. 对于其他版本，可查看 Miniconda Archive
$ wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

安装 Miniconda 发行版

$ bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

使用 Navigator

Anaconda Navigator

Anaconda Navigator 是 Anaconda 发行版中包含的桌面图形用户界面（GUI），可以通过 Navigator 轻松地管理 Python 环境、安装、更新和卸载各种软件包以及使用各种 IDE 工具，而无需使用终端命令。

Anaconda 已附带安装 Navigator，对于 Miniconda，可以使用 conda install anaconda-navigator 命令安装

使用下列命令启动 Navigator：

$ anaconda-navigator

更换软件源

选择一个国内镜像站，建议优先选择地理位置较近、相同运营商的镜像站 (1)

  1. 可在校园网联合镜像站中查询
推荐镜像站 镜像站帮助页（Anaconda）
清华大学镜像站（tsinghua） https://mirror.tuna.tsinghua.edu.cn/help/anaconda/
南京大学镜像站（nju） https://mirror.nju.edu.cn/mirrorz-help/anaconda/?mirror=NJU
上海交通大学镜像站（sjtu） https://mirrors.sjtug.sjtu.edu.cn/docs/anaconda
阿里云镜像站（aliyun） https://developer.aliyun.com/mirror/anaconda

以南京大学镜像站为例，复制下方的镜像源

常用第三方源 custom_channels
  • conda-forge：社区维护的开源包仓库，提供大量最新版本的跨平台软件。
  • pytorch（已弃用）：PyTorch 官方频道，提供深度学习框架及其扩展库。
  • nvidia：NVIDIA 维护的频道，包含 CUDA 工具包等 GPU 加速库。
  • intel：Intel 优化的数学库（如 MKL），提升 CPU 计算性能。
  • msys2：Windows 系统工具链频道，包含编译工具和依赖库（如 GCC、Git）。
  • bioconda：生物信息学专用频道，提供生物数据分析工具（如 SAMtools、BLAST）。
  • menpo：计算机视觉和图像处理工具库（如 dlib、OpenCV）。

在终端中执行下列命令，编辑软件源配置文件

$ gedit ~/.condarc

将配置文件中 channels 及相关部分替换为镜像源，并保存文件

更改为镜像源后，需要清除索引缓存

$ conda clean -i

更新 Conda 和 Navigator

$ conda update -n base conda       # 更新 Conda
$ conda update anaconda-navigator  # 更新 Navigator

指定更新版本

如果 conda 需要安装指定版本或最新版本 (1)，可以执行下列命令：

$ conda install -n base conda=xx.xx.xx

如果版本过低可能需要逐级更新，例如要从 conda 4.12 更新至 conda 23.10.0，需要先安装 conda 22.11.1

  1. 最新版本可查看 Releases · conda/conda

卸载 Navigator

$ conda remove anaconda-navigator

卸载 Anaconda

移除 anaconda3 目录以外的环境

将 ${PATH_TO_ENV_DIRECTORY} 替换为环境目录 (1)

  1. 可以使用 conda info --envs 命令查看所有环境及其目录
$ ~/anaconda3/_conda constructor uninstall --prefix ${PATH_TO_ENV_DIRECTORY}

移除所有终端配置文件中的 conda 初始化脚本

$ conda init --reverse --all

移除 .condarc 文件和 .conda、.continuum 目录

$ rm -rf ~/.condarc ~/.conda ~/.continuum

移除整个 anaconda3 及相关目录

$ rm -rf anaconda3
$ rm -rf ~/anaconda3
$ sudo rm -rf /opt/anaconda3

卸载 Miniconda

$ ~/miniconda3/uninstall.sh
命令可选项
  • --remove-caches：删除缓存文件（例如包缓存和索引缓存等）
  • --remove-config-files {user,system,all}：删除配置文件（例如 .condarc 文件），user 会移除当前用户主目录内的文件，而 system 会移除该目录外的所有文件
  • --remove-user-data：删除用户数据（例如 ~/.conda 目录）

常用命令 3

描述 命令
验证 conda 安装，检查版本等 conda info
创建环境 conda create --name ENVNAME python=3.10
删除环境 conda remove -n ENVNAME --all
激活环境 conda activate ENVNAME
列出已安装包 conda list
更新所有包 conda update --all
安装包（指定 channel） conda install -c CHANNELNAME PKG1 PKG2
conda install CHANNELNAME::PKGNAME
安装包（指定版本） conda install PKGNAME=3.1.4
conda install "PKGNAME>2.5,<3.2"
conda install "PKGNAME [version='2.5|3.2']"
安装包（文件列表） conda install --file FILENAME
卸载包 conda uninstall PKGNAME
列出所有环境及其位置 conda env list
导出环境文件
1. 跨平台兼容
2. 指定平台 + 包
3. 指定平台 + 包 + channel		 conda env export --from-history>ENV.yml
conda env export ENVNAME>ENV.yml
conda list --explicit>ENV.txt
导入环境文件 conda env create -n ENVNAME --file ENV.yml
conda create -n ENVNAME --file ENV.txt
删除所有未使用文件 conda clean --all
检查 conda 配置 conda config --show

  1. Installing Anaconda Distribution - Anaconda ↩

  2. Installing Miniconda - Anaconda ↩

  3. Conda Commands ↩